Если есть такая возможность, то лучше автоматизировать конечно. Это значительно упростит работу, многие задачи будет выполнять ПО, а не работники. Для автоматизации советую использовать 1С:Медицина
https://stoma1c.ru , данная crm давно уже себя зарекомендовала и функционал у неё обширный.